《舰指太平洋》在众多玩法中，创新增加了战舰科技树系统，作为独立的科技养成系统，为玩家带来各类型功能属性加成及功能拓展。

科技树以树状结构分布排列，按照指向依次激活各科技，需激活前置科技才可激活下一个。

激活科技需消耗科技点。

科技树分为四个章节，分别反映了二战海军发展的不同时代。