有一些矿物只有在地底深处才能找得到，而且对于游戏的进行来说十分重要。虽然在第一天一般只找得到煤矿石和铁矿石，但是全面了解Minecraft中所有的矿物也是有意义的。

 煤炭是Minecraft中普遍而又重要的矿物，它可以用来制作火把和在熔炉中烧炼物品。家中备有1组（64个）煤炭算是较为充足的储备，但对于长期来说你最好拥有几组的煤炭常备在家。当你正式开始采矿生涯后，你将会发现很多的煤炭，同时你也将用掉很多。尽管木炭能够从木头中获得并能够代替煤炭，但是木头还需要用来做其他事情，因此收集并储备大量煤炭是有必要的。

 铁锭可以称之为Minecraft中最重要而且用途最多的矿物。你可以用铁锭来制作高质量的工具、盔甲及其大量的其他用途，因此对于铁锭的收集可谓是越多越好。铁矿石需要石制或更高级别的镐才能够采集，而且采集铁矿石将不会掉落现成的铁锭，因此你需要将铁矿石放入熔炉中并冶炼才能够获得能够制作的铁锭。当你拥有铁锭的时候，首先用来制作一个铁制镐，一把铁制剑和一个桶（并装满水），然后再用来制作一套铁制盔甲（这将会消耗24个铁锭）。如果你还有更多的铁锭，便用来制作剪刀、另一个桶（用来装另一桶水来随时制作“无限水源”）。关于铁锭的合成表可以在这里看到。

 金锭、青金石和红石较为稀有——青金石矿石需要石制或更高级的镐采集，而金矿石和红石矿石需要铁制或更高级的镐才能采集。在开始的时候你并不太需要用到这些矿石，因此找到它们的时候并不需要急着采集。而且，它们只有在洞穴更深处才能够找得到。当你收集到一些金锭和红石的时候，最先能利用上它们的是用来制作指南针、钟和一些金苹果。在1.8时青金石不仅仅是染料，可以用来附魔。当你找到甘蔗的时候，你可以把甘蔗做成纸，进而制作地图来记录你走过的地方并防止迷路。

 钻石是一种十分稀有的矿物，也几乎是Minecraft中最抢手的资源。钻石可以用来制作十分耐用而且效率十分高的工具，以及十分坚固的盔甲。钻石矿石只能在世界的底部才能找得到（Y≤15），并且需要铁质或更高级的工具才能够采集。由于更低的海拔高度会碰上基岩或岩浆湖，因此在Y=11处进行搜索是最安全的。知道自己海拔高度的最好方法是通过按F3打开调试屏幕并获知当前在Y轴上的坐标。

 绿宝石通常获取于（和用于）与村民的交易中。但零星的绿宝石矿石能在峭壁（山脉）生物群系中找得到，与金矿石出现的位置相仿，并只能用铁制或更高级的镐采集。目前绿宝石不能用于制作工具，而与村民交易和信标成了它少数的使用手段。