在秦时明月手游的探索系统玩家不但可带领麾下弟子体验秦时明月动画中的恢弘史诗剧情，与各大英雄豪杰一决高下，还能使弟子快速成长，经历各种旷世奇遇。
探索：

探索规则：每次探索需要消耗1点体力，探索会获得银两和玩家经验奖励，部分关卡还有有几率掉落装备，弟子魂魄等道具，点开关卡可以查看关卡的详细信息。
关卡类型：分为普通，精英，BOSS三类，难度会逐渐上升。通常一个章节内有1个boss关卡，1-3个精英关卡，剩余均为普通关卡。
挑战次数：精英关卡及boss关卡有挑战次数限制，精英为10次，boss为5次，可通过元宝清空挑战次数。
关卡奖励：每个关卡有经验和银两奖励，额外有几率掉落各种装备、道具、弟子魂魄，难度越高的关卡掉落装备和弟子魂魄的品质越好。
关卡评价：分为一星，二星，三星三种，三星最高。战斗评价和战后剩余血量相关，剩余血量越多评价越高，关卡首次得到三星评价将会获得三倍的银两和弟子经验奖励。关卡失败仅可获得少量银币奖励。
声望奖励：每次探索会获得1点声望，当该章节声望达到要求时，可领取左上角标出的声望奖励。
奇遇：

高人指点：可让全体弟子同时获得大量经验奖励，可通过道具使效果翻倍。
卷宗寻宝：随机获得大量的宝箱，银币奖励，可通过道具使效果翻倍。
路见不平：可通过击败指定敌人获得内力丹奖励，若实力不济可放弃并获得银币。
不期而遇：获得机会以优惠价格招募指定弟子，放弃可获得该弟子魂魄。
云游商人：获得机会以优惠价格购买指定装备，放弃可获得随机装备。